10月20日消息,日本关西医科大学生物医学工程中心Giuseppe Pezzotti杰出教授领导的研究团队证明,病毒RNA分子结构的差异可以被捕获为拉曼条形码,据此能够识别20种新冠病毒(SARS-CoV-2)变异株与亚型。
拉曼光谱通过检测分子振动产生的特征散射信号获取化学指纹,无需标记、无需破坏样本。该团队的方法将不同变异株RNA的分子结构差异转化为可识别的光谱条形码,实现对毒株的逐一区分。研究成果有望推动开发新发变异株的快速鉴定方法,在变异株持续出现的背景下缩短从样本到分型的时间。
不同变异株的基因组变异会改变RNA的局部结构与碱基环境,进而在拉曼光谱上留下差异化的谱线组合——研究者将其类比为每种变异株独有的条形码,配合模式识别即可完成毒株辨识,无需对每个样本做全基因组扩增与测序,从而把分型周期从测序流程中解放出来;其挑战在于光谱信号细微、相近变异株的条形码差异可能很小,需要稳定的光学系统与算法支撑。若该方法经更大样本验证并向其他RNA病毒拓展,将为公共卫生监测网络提供一条低成本的快速分型通道,用于新发变异株的早期预警与流行病学追踪。
(来源:Phys.org)