KinetiDiff框架结合扩散模型与分子对接，设计ACVR1抑制剂亲和力提升19.2%

B910化工消息：4月24日消息，arXiv发表的一项研究提出KinetiDiff框架，用于针对罕见疾病靶点的从头药物设计。

进行性骨化性纤维发育不良症（FOP）是一种罕见疾病，其致病激酶为ACVR1（ALK2）。KinetiDiff框架将几何完备扩散模型与AutoDock Vina实时梯度引导结合，在分子生成过程中注入物理对接梯度，引导分子朝高亲和力构象演化。

在10000个扩散采样中，框架产生了9997个有效分子。最优候选分子的结合亲和力达到-11.05 kcal/mol（pKd=8.10），比晶体学参考配体提升19.2%。前100个候选分子全部超过参考配体，100%符合Lipinski规则，中位合成可及性为2.67。

该研究确立了梯度引导几何扩散作为针对罕见病激酶靶点生成高效、可合成抑制剂的实用方法。 （来源：arXiv）