日本团队突破AlphaFold3局限:AF3-ReD实现蛋白多构象采样
日本分子科学研究所Ohnuki与Okazaki团队在JACS Au发表AF3-ReD方法:在AlphaFold3扩散模型中引入排斥偏置能量项,迫使模型采样多个构象态。以ATP合酶F1β亚基验证,AF3-ReD成功采到默认模型遗漏的开放、闭合及中间构象,为药物设计中的构象变化研究提供新工具。
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日本分子科学研究所Ohnuki与Okazaki团队在JACS Au发表AF3-ReD方法:在AlphaFold3扩散模型中引入排斥偏置能量项,迫使模型采样多个构象态。以ATP合酶F1β亚基验证,AF3-ReD成功采到默认模型遗漏的开放、闭合及中间构象,为药物设计中的构象变化研究提供新工具。
2024年诺贝尔化学奖得主David Baker等人联合创立的GenBio AI发布全细胞虚拟模型AIDO Cell,加入虚拟细胞竞赛。该系统如人类细胞的Google Earth,可放大观察蛋白质与核酸,敲除基因或加入药物后预测细胞状态变化,公司称采用整体性方法对整个细胞系统整合建模,目标把生物试错迁移到计算环境,加速药物发现。