分子动力学

共 16 篇 · B910化工 · AI 化学信息库

DSCFT+MD联合方法更准确预测嵌段共聚物微相分离动力学

Alireza F. Behbahani、Jafar Cheraghalizadeh与Friederike Schmid在arXiv(2609.04548,9月3日提交、9月10日修订)发文,从Kremer-Grest分子动力学单链结构因子弛豫动力学与reptation理论出发构建迁移率函数,改进动态自洽场理论(DSCFT)对均聚物共混物旋节分解与嵌段共聚物微相分离动力学的预测精度,优於传统Debye型迁移率。

B910化工 9月12日 07:18 124

arXiv:脂膜剪切黏度的「分子界面流变」测量新方法问世

美国特拉华大学Zhi-Xun Xu与Amaresh Sahu(arXiv:2609.05373,9月4日提交)开发从平衡分子动力学模拟中提取脂质双层膜剪切黏度的方法——「分子界面流变」:借助Mori-Zwanzig形式主义调和膜横向速度自相关函数的阻尼振荡与慢衰减尾,可推广至三维介质中的一般界面系统。

B910化工 9月9日 06:19 150

日本团队突破AlphaFold3局限:AF3-ReD实现蛋白多构象采样

日本分子科学研究所Ohnuki与Okazaki团队在JACS Au发表AF3-ReD方法:在AlphaFold3扩散模型中引入排斥偏置能量项,迫使模型采样多个构象态。以ATP合酶F1β亚基验证,AF3-ReD成功采到默认模型遗漏的开放、闭合及中间构象,为药物设计中的构象变化研究提供新工具。

B910化工 9月6日 06:33 164

病毒衣壳内RNA基因组的静电组织规则:分子动力学模拟揭示离散电荷位点主导局部排布

Xintong Jiang等研究者用显式离子、显式水与完整库仑静电的分子动力学模拟,研究带离散N端类电荷位点的模型病毒衣壳内线性聚电解质的组织规律。模拟验证了平均场理论对径向密度分布的预测,同时发现总静电耦合决定全局组织、几何细节调制局部基因组-壳壁接触;盐浓度升高使平衡时间延长七倍,揭示了平衡理论无法触及的动力学效应。

B910化工 8月31日 23:44 140

德国团队用高斯过程回归打通边界润滑多尺度建模:分子动力学直接喂给连续介质求解器

Hannes Holey、Michael Moseler、Peter Gumbsch与Lars Pastewka在arXiv发表研究,用基于高斯过程(GP)回归的非参数多尺度框架建模边界润滑:以十六烷受限金表面体系(压力至1GPa、间隙低至1.4纳米)的非平衡分子动力学模拟训练GP代理模型,直接向连续介质薄膜求解器提供应力预测,绕过固定形式的本构定律,突破受限尺度下半经验本构模型失效的困境。

B910化工 8月30日 12:17 156

哥伦比亚大学模拟研究揭示塑料焊接强度之谜:焊缝分子"记忆"诱发额外结晶,接缝比管材本身更坚固

哥伦比亚大学Michele Valsecchi团队在《物理评论快报》发表分子动力学模拟研究:聚乙烯焊接界面处残留的原始表面分子取向在冷却时成为额外结晶的"种子",使焊缝比周围管材更结晶、更刚硬,受力时裂缝被推向焊缝之外的软质管材——这解释了为何合格焊接接头可以和管材一样强甚至更强,且该机制同样适用于回收聚乙烯。

B910化工 8月30日 12:17 139

聚合物链断裂动力学理论:三维构象涨落可使断裂速率相差数量级

牛津大学等机构研究者在arXiv发表统计力学框架,将拉伸下聚合物链断裂在过渡态理论中表述为多通道首断问题,发现三维构象自由度增强断裂、而有限弯曲刚度引入的取向关联可逆转该增强并在高刚度时将断裂速率降低数量级,断裂速率还依赖于键位置,为聚合物网络损伤与断裂模型提供分子级输入。

B910化工 8月26日 12:24 148

arXiv论文:分子动力学模拟揭示液相间约束气膜热力学,表面张力随膜厚指数衰减并自发成泡

8月19日提交至arXiv的研究用分子动力学模拟系统研究了约束于两液体体相之间的纳米气膜,发现气膜表面张力随膜厚减薄呈指数下降、分离压负值增大,平面气膜会经液桥形成自发转变为球形气泡,较大膜面积下MD与经典密度泛函理论的偏差源于热毛细波涨落,对理解多相催化、浮选与地下储能中的约束流体有参考价值。

B910化工 8月20日 19:47 140

arXiv研究首次实现手性分子对映体特异性取向动力学的直接成像

Kenta Mizuse、Ilya Sh. Averbukh、Yasuhiro Ohshima等研究者在arXiv发表论文,首次在气相孤立手性分子中实现了对映体特异性取向动力学的超快成像。研究团队利用飞秒激光脉冲对引发手性分子2-甲基氧丙环的单向相干旋转,通过时间分辨库仑爆炸成像技术观测了两种对映体的镜像取向动态,为手性动力学的实时观测和控制开辟了新途径。

B910化工 6月29日 23:56 266