9月18日消息，据C&EN报道，生物技术公司Enveda正重启国际计算化学竞赛CASMI（Critical Assessment of Small Molecule Identification），试图为质谱领域长期存在的"暗代谢组"难题寻找突破口。

在利用质谱（MS）表征生物样本小分子代谢物的典型实验中，科学家无法确定其中约90%可检测分子的化学结构。质谱方法多年来不断演进，但构成"暗代谢组"的分子始终困扰着研究者——代谢组学本质上存在一个数据问题。

CASMI竞赛在2012至2022年间不定期举办，Enveda此番将其重新推出，并希望新竞赛的吸引力能超越质谱代谢组学圈层，扩展至更广泛的机器学习社区。竞赛目标是开发一种算法，仅凭分子的串联质谱谱图——即分子被电离后裂解成的碎片"指纹"——就正确鉴定其结构。

"我们认为有一条可规模化的路径去表征全世界的化学，其意义堪比DNA测序。"Enveda首席执行官Viswa Colluru表示。

CASMI在很大程度上借鉴了蛋白质结构预测竞赛CASP的经验——CASP曾催化出突破性的蛋白质折叠人工智能模型AlphaFold。"CASMI的灵感来自CASP，"Enveda首席技术官August Allen说，"区别在于CASMI至今没有迎来它的AlphaFold时刻……而这正是我们想要推动的。"不过他也指出，CASP参赛者可以依靠近50年积累的结构化数据，而质谱领域的数据基础远不如其成熟。

从产业视角看，若小分子结构鉴定能够实现自动化与规模化，天然产物活性成分筛选、药物先导化合物发现以及环境污染物溯源等环节的研发效率都将显著提升，这也是Enveda等专注于天然产物生物属性的公司的核心利益所在。 （来源：C&EN）