8月19日消息，由多伦多大学Timothy Hughes领导的国际团队合作在《自然》（Nature）发表研究，构建了迄今最全面的人类转录因子DNA结合偏好目录"Codebook"，瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）Bart Deplancke实验室在其中发挥了核心作用。

人体每个细胞携带几乎相同的DNA，但脑细胞、肌肉细胞和免疫细胞的行为截然不同，差异主要在于细胞如何"阅读"遗传指令。转录因子结合特定DNA序列，控制基因何时何地活跃， directing从胚胎发育到免疫功能的各种过程；调控出错则可能致病。然而人类基因组约有1600个转录因子，其中许多的DNA结合偏好一直未知。

研究团队将五个实验平台与计算分析相结合，完成了超过4800次实验，为此前表征不足的177个转录因子鉴定出DNA结合模体，为人类基因调控的已知"词汇表"新增约130个不同模体。EPFL教授、共同通讯作者Deplancke表示："我们的基因组包含生命的指令，但理解细胞究竟如何阅读这些指令，一直是生物学的重大挑战之一。这项工作让我们离完整的基因表达控制蛋白词典更近一步。"

该成果的应用前景直接而广泛：完整的转录因子结合目录是理解细胞分化的基础工具，可为基因调控网络建模、罕见病致病变异解读以及细胞疗法中细胞身份控制提供参照系。结合表观遗传修饰（如DNA甲基化）数据，这类"密码本"将成为AI预测基因表达的核心训练语料。 （来源：Phys.org）