9月30日消息,据C&EN报道,贝勒医学院与科技公司SandboxAQ的联合团队开发出一种基于片段的分子胶发现方法,论文发表于Nature Communications(DOI: 10.1038/s41467-026-77657-z,9月12日上线)。团队称这一工作流为寻找"将两个蛋白质拉到一起"的黏性小分子提供了更便宜、更易上手的路径。

研究从苯基谷氨酰亚胺(phenyl-glutarimide)聚焦片段库出发,用高通量蛋白质组学检测片段处理细胞后全蛋白质组的变化,筛出两个对免疫相关信号蛋白VAV1有降解活性的先导分子(化合物11和12)。两个分子初始降解活性较弱,但策略意图明确:先以小片段扫描化学空间获得弱命中,再逐步演化成更强力的分子胶。SandboxAQ随后对配体-VAV1蛋白互作进行AI模拟建模,指导化合物改造以提升胶水活性。贝勒下一代治疗中心主任Jin Wang解释:小分子更容易覆盖化学空间,找到弱命中后再演化,比直接筛选大分子库成本更低。

分子胶通过诱导靶蛋白与E3连接酶形成新型蛋白-蛋白界面实现降解,可触及传统PROTAC难以覆盖的位点,是药物化学的火热赛道,但既往发现高度依赖偶然命中。该工作流把"片段库+蛋白质组表型筛选+AI结构预测"串成闭环,若VAV1等免疫靶点管线验证成功,或为激酶类等经典难靶提供全新的可编程降解路径。 (来源:C&EN)