Jennifer Doudna团队用AI设计CRISPR样核酸酶,部分变体编辑活性超野生型
加州大学伯克利分校Jennifer Doudna团队在《Science》发表研究(DOI: 10.1126/science.aed6123),使用混合AI策略设计基于TnpB蛋白家族的CRISPR-Cas12样核酸酶变体(SynTnpB)。研究者将进化数据约束与反向蛋白质折叠模型结合,分别设计DNA结合界面和向导RNA结合界面,在大肠杆菌中组合筛选约50个候选。最优SynTnpB与野生型TnpB仅有77%序列同一性,但编辑活性等于甚至超过野生型,并在人类和植物基因组中验证了编辑功能。